肇庆医学高等专科学校始建于1958年，前身为中山医学院肇庆分院，后更名为广东省肇庆卫生学校。多年来，在肇庆市委、市政府的正确领导和大力支持下，在省教育厅、卫生厅的关怀与指导下，学校不断发展壮大，2004年5月升格为肇庆医学高等专科学校，成为广东省唯一一所独立建制的、公办医学高等专科学校。
学校现有两个校区，分别位于肇庆市端州区和鼎湖区，总占地面积23.7万平方米，总建筑面积11.2万平方米；校本部建有8个校内实验实训基础，拥有各类实验、实训、仿真、模拟技能训练室等98个；各教室、实验室均配备现代化的电教设备，教学科研仪器设备价值达2680余万元；馆藏图书25余万册；拥有肇庆市口腔医院等3所附属医院及50个校外实习基地，与100多所医院(医企)建立了各种合作关系。为高素质技能型卫生人才提供了良好的条件。
现设有临床医学系、护理系、医技药学系和基础部四个二级教学单位；招生的专业有：护理、临床医学、药学、口腔医学、助产、医学检验技术、康复治疗技术、卫生检验与检疫技术等8个专业。护理、临床医学和药学专业为学校重点建设专业，其中护理专业是国家财政部重点资助项目、广东省示范性建设专业、省高职高专教育实训基地。目前，专科护理专业与菲律宾、加拿大、香港等高校开展出国护士培训项目及学生交流活动，为护理专业学生出国就业和进一步深造提供平台。学校现有教职工382人，教师总数292人，其中专任教师208人，校外兼职兼课教师54人，校内兼课教师30人。全日制专科在校生3759人，成人业余专科生1623人。
学校在办学过程中，不断探索、创新人才培养模式，在高等卫生职业教育实践中做到“务实创新”、“与时俱进”。
在“九五”期间，学校制定并实施了“以医助教、以教促医、医教相长、两翼齐飞”的发展方略。十多年来，在办学模式等方面做了积极、有益的探索与实践。“十一五”期间，学校党政领导班子带领全校教职工，认真学习教育部、卫生部有关职业教育相关文件，总结提升卫生职业教育办学理念，进一步探索与行业“校院合作、医教结合”的人才培养模式，着力构建“一个平台”（“校院合作、医教结合”育人平台）；深化“三个合作”（校院合作共构人才培养方案、校院合作共建教学团队、校院合作共建实训基地）；实施“四个对准”（对准市场设专业、对准岗位设课程、对准能力抓实践、对准德育抓素质）。
作为省内唯一一所独立建制的医学高等专科学校，为农村基层培养高素质技能型卫生专业人才，是广东省及肇庆市经济社会发展赋予学校的重要责任，也是学校办学过程中积极探索和实践的动力源泉。根据广东省及肇庆市“十一五”卫生事业发展规划和高等职业教育发展的新形势，结合农村基层对高素质技能型卫生人才的需求，学校进一步明确了办学思路与定位，提升了办学理念。办学定位： “立足肇庆、辐射广东、面向基层（农村）、服务社会”。人才培养目标：培养“下得去、用得上、留得住”的基层（农村）高素质技能型卫生人才。办学理念：“育人为本、质量立校、人才强校、特色兴校”。办学模式：以服务为宗旨，以就业为导向，以职业能力培养为本位，走“校院合作、医教结合”的发展道路。发展目标：一是成为广东省和肇庆市广大农村、社区卫生行业高素质技能型专业技术人才的培养基地； 二是成为肇庆市及周边地区在职卫生技术人员继续教育的培训基地；三是成为肇庆市社会医疗服务的重要力量；四是成为肇庆市卫生行业先进医护技术吸收、消化、转移和创新的基地。
五十余年的辛勤耕耘，几代肇医（卫校）人的不懈努力，已为社会培养了卫生专业技术人才3万余名，毕业生遍布全省各级医疗卫生机构，许多校友已成为所在单位的技术、管理骨干。近年来，学校先后被评为“广东省职业教育先进单位”、“教书育人先进集体”、“职业技术教育培训基地建设先进单位”、“国家紧缺（护理）人才培养培训试点基地”、“文明单位”、“文明校园”等荣誉称号。