云南省保山卫生学校创建于1965年6月，创建初期校名为“保山半农半读卫生学校”，校址在保山城西南郊小梨园现址，1966年5月，改为“保山专区卫生学校”。1972年3月保山滇西干部疗养所撤销，房屋资产及所有人员归并入卫生学校，学校由小梨园迁至该所，地址位于保山城西太保山脚，小梨园原校址留作学校生产基地。同年7月，成立保山地区卫生学校革命委员会。1978年11月，校名确定为云南省保山卫生学校。1981年，保山地委决定在卫校校址成立保山地区中医医院，卫生学校迁往小梨园原址办学，并重新在小梨园扩建校园。1981年8月，经中共保山地委决定，保山卫生学校定为县处级单位，仍隶属于保山行署卫生局主管。
1965年建校时无校舍，暂借保山化工厂车间1500平方米作为临时校舍。1966年校址确定在小梨园，占地2万多平方米，建盖了土木结构房屋。1972年3月搬至原滇西干部疗养所（太保山脚）地址，至1981年又搬回小梨园原址，期间学校基建停顿。此后，逐年建盖了办公楼、学生宿舍、教学大楼和教职工宿舍等。至1987年底，学校占地面积为33878平方米，建筑面积7806.29平方米，并逐步进行了校园绿化。
到2005年，学校占地面积127亩，总资产3800万元，建筑面积55000平方米，实验仪器设备总值560万元，图书6万册，有教职工117人，其中专任教师80人。学校在楚雄、大理、保山、临沧、德宏、怒江等州市县有临床教学实习医院34所，每年均可为近千名毕业学生提供良好的临床实习条件；学校开设的专业有中专专业10个，五年制大专专业2个，成人高等学历教育专科专业6个，专升本专业2个，已经成为具有良好办学条件和较高办学水平的国家级重点中专学校。
根据中专卫校的教育目标，二十世纪九十年代开始，学校不断加大教学改革力度，www.dxs89.com全面推进素质教育，对各个专业的课程设置，教学内容，教学方法，考试考核等进行全面改革。在抓理论教学的同时，重视学生操作技能和动手能力的培养，从加强实验室建设，改善办学条件入手，努力提高实验、示教的开出率；充分利用录像、电影、电脑、多媒体等先进设备进行教学，广泛使用VD题库；坚持开展教考分离和校内小统考，加大了对教学环节、教学过程、教学效果的监控力度。同时学校尽最大努力，保证教学经费的投入，确保各项教学经费的需要，为教学质量的提高提供了有效的经费支持。1999年以来，毕业生参加全省毕业理论统考3次，均获“成绩优良奖”，其中1次获第一名，两次获第二名。截止目前，已经有不同专业的近2万名学生毕业，分布于全省城乡医疗机构。
学校于2003年9月招收缅甸学员68人，该班学员经过两年的专业知识学习和临床实习，圆满完成了各专业的学习任务，于2005年8月毕业。首次涉外医疗班的开办，扩大了保山对外交流的渠道，拓展了保山卫校的办学空间，为今后的对外合作与交流，开办留学生班积累了宝贵的经验。
通过近十年的探索实践，学校不断推进后勤管理改革，基本实现了后勤服务社会化，建立起一套切合学校实际的后勤管理机制，为学校的建设和各项工作的开展发挥了重要的保障作用。
2006年2月，国家教育部根据有关法律以及全国高校设置评议委员会的评议结果，同意在保山卫生学校的基础上建立保山中医药高等专科学校。